More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0082 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3750  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0653422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4034  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.235716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  43.82 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1452  histone-like DNA-binding protein  43.43 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1203  histone-like DNA-binding protein  43.43 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1717  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000293556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2795  histone family protein DNA-binding protein  43.01 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.01 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0808808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1388  DNA-binding protein HU, form N  43.01 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  44.83 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  41.57 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  36.56 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  43.01 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  36.56 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  40.86 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  43.18 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0506  histone family protein DNA-binding protein  43.02 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  43.18 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  42.55 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  43.33 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  43.01 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  42.55 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  40.43 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4352  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614172 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  41.94 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  40.45 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0336  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2248  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  39.33 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  38.71 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  38.2 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  41.49 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  41.11 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  41.49 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  35.96 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1892  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127774  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  37.08 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2223  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  40.86 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  40.82 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  38.2 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  37.08 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  37.08 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3224  histone family protein DNA-binding protein  32.58 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  39.33 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  37.08 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>