More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4202 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4202  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0673  histone family protein DNA-binding protein  61.96 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4008  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  54.65 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  51.11 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  52.17 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  48.28 
 
 		 88 aa  90.5  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  52.33 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  51.16 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  48.35 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  47.67 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  48.84 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 95 aa  87  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  87  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  45.35 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  51.16 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  50 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  50.62 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  50.62 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  48.84 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  45.26 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  48.84 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.84 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  46.51 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.51 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  43.48 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  46.51 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  43.62 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  48.84 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  47.67 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  43.62 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16074  predicted protein  43.18 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  46.07 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  45.35 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>