More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4358 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4352  histone family protein DNA-binding protein  89.47 
 
 		 123 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  41.11 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  40 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  43.33 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  44.83 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  42.22 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  39.56 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  42.05 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  42.53 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3356  histone-like DNA-binding protein  41.05 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.860208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  41.05 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  44.83 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  43.33 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1893  histone family protein DNA-binding protein  40.43 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.73585  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  40 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  38.46 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  43.68 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  43.68 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  40 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  40.22 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.22 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  40.22 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  41.11 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  43.01 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  38.89 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  38.04 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1051  histone family protein DNA-binding protein  37.5 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000497636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  39.08 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  40.66 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  38.37 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  39.08 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  36.67 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  36.67 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  39.36 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  38.46 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  35.56 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2639  histone family protein DNA-binding protein  41.05 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000564133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  41.98 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  39.08 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  31.11 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2857  histone family protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000465869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  38.89 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0336  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  41.11 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  37.93 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>