More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0336 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0336  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3288  DNA-binding protein HU  79.17 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.36981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2795  histone family protein DNA-binding protein  78.49 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1388  DNA-binding protein HU, form N  77.42 
 
 		 95 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2801  histone-like DNA-binding protein  77.66 
 
 		 97 aa  150  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0055  histone family protein DNA-binding protein  77.42 
 
 		 95 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0808808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0405  histone family protein DNA-binding protein  75.53 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0984  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1266  DNA-binding protein HU family  42.22 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  40.66 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  40.66 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2724  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.032856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0082  histone-like DNA-binding protein  43.82 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  43.33 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2320  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  43.96 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16074  predicted protein  40.45 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  44.94 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3555  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3231  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3392  HU family DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000680811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  40 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4358  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.847271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4335  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4203  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6198  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309609  normal  0.013935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  43.33 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3302  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  40 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  42.22 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1743  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  39.56 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5718  histone family protein DNA-binding protein  44.71 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0779514  normal  0.621503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  40.66 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2026  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000760647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  41.76 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3538  HU family DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00490432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  40.66 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2029  histone family protein DNA-binding protein  40.86 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19160  nucleoid DNA-binding protein  44.19 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>