More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0913 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
514 aa  1009    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00710557  normal  0.212573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2175  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.45 
 
 
530 aa  306  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.87 
 
 
513 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
534 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
530 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.64 
 
 
566 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
555 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
555 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 
562 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 
533 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.5 
 
 
552 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.85 
 
 
547 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  49.85 
 
 
547 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.85 
 
 
547 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.85 
 
 
547 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 
579 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 
565 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
555 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
555 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.3 
 
 
567 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  48.47 
 
 
579 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.85 
 
 
547 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.46 
 
 
575 aa  276  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3195  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0463138  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.97 
 
 
519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 
541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  53.52 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  53.52 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.04 
 
 
556 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.52 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.64 
 
 
519 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.49 
 
 
661 aa  273  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 
556 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.62 
 
 
570 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 
555 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.55 
 
 
541 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2587  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
550 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.83115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
556 aa  270  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
642 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
651 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
556 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.09 
 
 
561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
628 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.93 
 
 
630 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
572 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
653 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0240769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
547 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.779493 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.08 
 
 
574 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
547 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.601659  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.92 
 
 
542 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
525 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
547 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 
573 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
628 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 
505 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0409416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 
559 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 
585 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.51 
 
 
557 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  48.92 
 
 
533 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  48.92 
 
 
533 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  48.61 
 
 
533 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.35 
 
 
516 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 
547 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
599 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 
533 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  48.61 
 
 
533 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
562 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248385  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.77 
 
 
546 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.62 
 
 
470 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  48.77 
 
 
546 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
546 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  48.77 
 
 
546 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
630 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.17 
 
 
601 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  48.3 
 
 
533 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  48.52 
 
 
553 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.77 
 
 
546 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
562 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  48.61 
 
 
533 aa  262  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.48 
 
 
553 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.48 
 
 
553 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 
635 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.48 
 
 
553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  48.3 
 
 
533 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.48 
 
 
553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.42 
 
 
553 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.46 
 
 
546 aa  261  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 
546 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.15 
 
 
553 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3975  methyl-accepting chemotaxis protein  49.21 
 
 
601 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.15 
 
 
553 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.15 
 
 
553 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.42 
 
 
553 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.42 
 
 
553 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5250  methyl-accepting chemotaxis protein, sensory transducer  55.27 
 
 
677 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837898  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  54.15 
 
 
553 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
546 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3894  methyl-accepting chemotaxis protein  49.21 
 
 
601 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0518753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>