More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0658 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.369751  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.19 
 
 
279 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.99 
 
 
279 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.62 
 
 
279 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
289 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00661065  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5089  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  57.58 
 
 
293 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.52 
 
 
291 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.04 
 
 
289 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  0.758242 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  51.87 
 
 
296 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.58 
 
 
287 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3890  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  48.52 
 
 
301 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.52 
 
 
301 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.656131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5257  putative ABC transporter (permease protein)  45.63 
 
 
296 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216925  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
296 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0788732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
299 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
299 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.68 
 
 
283 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.292218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.4 
 
 
296 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
324 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
313 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
296 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
298 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
285 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  40.15 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  40.15 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  40.15 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  40.15 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
296 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  40.15 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
299 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  43.12 
 
 
301 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.28 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1497  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.4 
 
 
320 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.726919  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50093  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
304 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.7 
 
 
321 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.28 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
867 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
296 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
288 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  43.07 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  45.72 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 
300 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  39.58 
 
 
304 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5120  putative ABC transporter permease protein  46.03 
 
 
305 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.30642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
284 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
294 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
295 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
293 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5090  ABC transporter permease  47.54 
 
 
299 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.661687  normal  0.572784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
296 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.82 
 
 
308 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
280 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 
285 aa  208  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
309 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
280 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 
288 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.700079  normal  0.152273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
303 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.54 
 
 
300 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
285 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.32 
 
 
314 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
300 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
293 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  40 
 
 
279 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  40.86 
 
 
308 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
298 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.870521 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  42.12 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
301 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
301 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.77 
 
 
282 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
300 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  41.45 
 
 
300 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
296 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
286 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4563  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
294 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 
304 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
309 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.66 
 
 
317 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.979311  normal  0.485884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4240  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.18 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247353  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>