More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1789 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1789  single-strand binding protein  100 
 
 		 138 aa  280  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00011085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  34.33 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  35.16 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  38.38 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  33.58 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  33.08 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  34.27 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  30.82 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  35.11 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  34 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  30 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  32.46 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  25.62 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  30.22 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  30.16 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  32.31 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1045  hypothetical protein  28.06 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1010  hypothetical protein  28.06 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 192 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  26.27 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  31.34 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.03 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  25.76 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  25.87 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  35.05 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  28.1 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  29.09 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  32.71 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  28.97 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  30.1 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  26.27 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  30.56 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  31.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  29.7 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  29.36 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>