More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1010 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1045  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1010  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  34.72 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 238 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 222 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  41.73 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  41.73 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  34.72 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 236 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  45.87 
 
 		 231 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 234 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  38.57 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  42.34 
 
 		 154 aa  95.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48 
 
 		 178 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40.87 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40.87 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 181 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  42.62 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.29 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  43.64 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  47 
 
 		 180 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  43.64 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  43.36 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 174 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 200 aa  90.5  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  47 
 
 		 181 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 220 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  40.94 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 186 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 242 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  42.02 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 185 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 179 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  39.09 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 184 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 196 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>