90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5476 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4921  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  99.7 
 
 		 334 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5218  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  96.14 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5641  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  96.14 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5476  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 334 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3206  monosaccharide-transporting ATPase  95.51 
 
 		 334 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714787  normal  0.152598 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4588  monosaccharide-transporting ATPase  96.14 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0044  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  96.44 
 
 		 337 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1628  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  90.46 
 
 		 340 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3008  Monosaccharide-transporting ATPase  83.23 
 
 		 334 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2598  Monosaccharide-transporting ATPase  83.53 
 
 		 334 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4217  monosaccharide-transporting ATPase  84.13 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3960  Monosaccharide-transporting ATPase  83.83 
 
 		 334 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1019  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  61.63 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2758  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  52.69 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630408  normal  0.800518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2587  Monosaccharide-transporting ATPase  52.73 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2997  Monosaccharide-transporting ATPase  52.12 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3477  Monosaccharide-transporting ATPase  51.84 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3765  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.84 
 
 		 327 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal  0.775581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0546  monosaccharide-transporting ATPase  53.42 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.42 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3703  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  53.27 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.639634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0589  monosaccharide-transporting ATPase  53.42 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232897  normal  0.0445099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0138  twin-arginine translocation pathway signal  53.09 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.09 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2764  monosaccharide-transporting ATPase  52.44 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.394894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2486  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3299  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0406  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3484  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.684575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3486  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1266  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3448  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  53.31 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1179  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.98 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0546  ABC sugar(arabinose) transporter, periplasmic ligand binding protein  52.44 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344202  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3411  Monosaccharide-transporting ATPase  51.71 
 
 		 332 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  0.170943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3600  monosaccharide-transporting ATPase  52.49 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2615  monosaccharide-transporting ATPase  51.47 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1789  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.75 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47034  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3777  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.89 
 
 		 330 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0214  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.32 
 
 		 456 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1196  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1214  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1057  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0046  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.717864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0371  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1714  L-arabinose-binding periplasmic protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1627  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1912  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.19 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.25 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1885  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.04 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2261  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  46.04 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1999  monosaccharide-transporting ATPase  46.04 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2476  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.34 
 
 		 329 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2637  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.62 
 
 		 329 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000871652 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1997  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00288662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01869  L-arabinose transporter subunit  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1742  Monosaccharide-transporting ATPase  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1734  monosaccharide-transporting ATPase  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.783762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01858  hypothetical protein  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1285  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0482207  hitchhiker  0.00000138898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2132  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.62 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2329  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.94 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.702527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1025  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.62 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.62 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2245  monosaccharide-transporting ATPase  45.31 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000240134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2638  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  43.15 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2371  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.51 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129907  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4141  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.87 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5010  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.4 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152302  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.91 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3000  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3338  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.87 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0517  D-ribose transporter subunit RbsB  22.14 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1337  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.83 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11060  monosaccharide-binding protein  26.16 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  24.19 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  24.19 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  24.19 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1599  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.81 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.89 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00471967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5187  D-ribose transporter subunit RbsB  25.68 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0574953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4119  D-ribose transporter subunit RbsB  25.68 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4243  D-ribose transporter subunit RbsB  25.68 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03582  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00518541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4267  D-ribose transporter subunit RbsB  24.9 
 
 		 294 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00505283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3967  D-ribose transporter subunit RbsB  24.9 
 
 		 294 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.56483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03637  D-ribose transporter subunit  25.68 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00458293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>