79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0046 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1214  putative periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1627  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1057  putative periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1714  L-arabinose-binding periplasmic protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0214  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  100 
 
 		 456 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0371  putative periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0046  putative periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 333 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.717864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1196  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  97.6 
 
 		 333 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1789  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  86.77 
 
 		 331 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47034  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0546  ABC sugar(arabinose) transporter, periplasmic ligand binding protein  64.2 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344202  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2758  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  64.47 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630408  normal  0.800518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3411  Monosaccharide-transporting ATPase  62.96 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  0.170943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2764  monosaccharide-transporting ATPase  64.82 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.394894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2997  Monosaccharide-transporting ATPase  61.96 
 
 		 334 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0406  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3299  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1266  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3448  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3486  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2486  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3484  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  66.56 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.684575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2587  Monosaccharide-transporting ATPase  61.96 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0589  monosaccharide-transporting ATPase  63.84 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232897  normal  0.0445099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.17 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0546  monosaccharide-transporting ATPase  64.17 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.17 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0138  twin-arginine translocation pathway signal  64.17 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2615  monosaccharide-transporting ATPase  64.17 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3703  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  63.73 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.639634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1179  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  65.56 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3765  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.17 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal  0.775581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3477  Monosaccharide-transporting ATPase  55.56 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3777  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  58.96 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3600  monosaccharide-transporting ATPase  56.15 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1628  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  51.06 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190381  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4588  monosaccharide-transporting ATPase  50.77 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5641  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.77 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5218  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.77 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5476  monosaccharide-transporting ATPase  52.43 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0044  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  51.06 
 
 		 337 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4921  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.1 
 
 		 334 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3206  monosaccharide-transporting ATPase  51.75 
 
 		 334 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714787  normal  0.152598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3008  Monosaccharide-transporting ATPase  48.19 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2598  Monosaccharide-transporting ATPase  47.58 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1019  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.96 
 
 		 335 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3960  Monosaccharide-transporting ATPase  48.54 
 
 		 334 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4217  monosaccharide-transporting ATPase  49.84 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2476  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.35 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1912  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.23 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1742  Monosaccharide-transporting ATPase  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01858  hypothetical protein  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1734  monosaccharide-transporting ATPase  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.783762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1285  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0482207  hitchhiker  0.00000138898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01869  L-arabinose transporter subunit  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2132  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1997  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.71 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00288662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1025  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.71 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2637  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  45.4 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000871652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1999  monosaccharide-transporting ATPase  44.79 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2261  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  44.79 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1885  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  44.79 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.92 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2245  monosaccharide-transporting ATPase  45.09 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000240134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.79 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2329  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.79 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.702527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2638  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  42.51 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4141  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.08 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2371  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.22 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129907  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5010  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.46 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152302  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11060  monosaccharide-binding protein  27.1 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.62 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.75 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.79248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3000  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.14 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3338  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.89 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  24.51 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2341  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.27 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.0483299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2621  ABC xylose transporter, periplasmic ligand binding protein  29.41 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6010  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  33.62 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  28.33 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>