89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1628 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1628  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  100 
 
 		 340 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190381  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5218  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  90.99 
 
 		 337 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5641  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  90.99 
 
 		 337 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4588  monosaccharide-transporting ATPase  90.99 
 
 		 337 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0044  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  90.39 
 
 		 337 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3206  monosaccharide-transporting ATPase  91.32 
 
 		 334 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714787  normal  0.152598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4921  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  89.52 
 
 		 334 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5476  monosaccharide-transporting ATPase  89.82 
 
 		 334 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3008  Monosaccharide-transporting ATPase  84.43 
 
 		 334 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4217  monosaccharide-transporting ATPase  85.93 
 
 		 334 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2598  Monosaccharide-transporting ATPase  85.03 
 
 		 334 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3960  Monosaccharide-transporting ATPase  83.83 
 
 		 334 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1019  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  62.54 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3477  Monosaccharide-transporting ATPase  55.08 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2758  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  53.5 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630408  normal  0.800518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3765  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  54.77 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal  0.775581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2997  Monosaccharide-transporting ATPase  52.73 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2587  Monosaccharide-transporting ATPase  52.73 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0546  monosaccharide-transporting ATPase  52.4 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0546  ABC sugar(arabinose) transporter, periplasmic ligand binding protein  52.4 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344202  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.4 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3411  Monosaccharide-transporting ATPase  51.8 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  0.170943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0589  monosaccharide-transporting ATPase  52.4 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232897  normal  0.0445099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3703  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  52.08 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.639634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1179  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.97 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2764  monosaccharide-transporting ATPase  52.08 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.394894 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0406  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1266  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3484  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.684575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3486  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2486  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3299  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.08 
 
 		 331 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0138  twin-arginine translocation pathway signal  52.08 
 
 		 331 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3448  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  53.64 
 
 		 331 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3600  monosaccharide-transporting ATPase  53.5 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2615  monosaccharide-transporting ATPase  52.58 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3777  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.46 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1789  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.45 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47034  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0214  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.32 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1057  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1214  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1627  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1714  L-arabinose-binding periplasmic protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0371  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0046  putative periplasmic sugar-binding protein  52.32 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.717864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1196  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  51.66 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1912  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.3 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2029  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.98 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.62 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2261  L-arabinose ABC transporter periplasmic-binding protein  48.47 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1999  monosaccharide-transporting ATPase  48.47 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1885  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  48.47 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2637  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.35 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000871652 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01858  hypothetical protein  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01869  L-arabinose transporter subunit  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1285  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0482207  hitchhiker  0.00000138898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1734  monosaccharide-transporting ATPase  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.783762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1742  Monosaccharide-transporting ATPase  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1997  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00288662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2132  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.35 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1025  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  46.35 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2329  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.35 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.702527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2476  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.68 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2245  monosaccharide-transporting ATPase  46.5 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000240134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4141  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.47 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2638  L-arabinose ABC transporter, periplasmic L-arabinose-binding protein  42.43 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2371  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.37 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129907  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5010  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.48 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152302  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2682  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3000  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1337  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.79 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3338  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.63 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2973  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  26.52 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1874  ribose ABC transporter periplasmic ribose-binding protein  26.52 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3045  monosaccharide-transporting ATPase  26.52 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.17 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2812  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.29 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.96 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4615  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  25.22 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11060  monosaccharide-binding protein  26.16 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  25.78 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03582  hypothetical protein  25.3 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00518541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5187  D-ribose transporter subunit RbsB  25.3 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0574953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4119  D-ribose transporter subunit RbsB  25.3 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4243  D-ribose transporter subunit RbsB  25.3 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4113  D-ribose transporter subunit RbsB  24.41 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114782  normal  0.0406773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03637  D-ribose transporter subunit  25.3 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00458293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>