More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0920 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  52.4 
 
 		 916 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0920  chaperone ClpB  100 
 
 		 756 aa  1489    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516277  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.94 
 
 		 884 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  68.98 
 
 		 889 aa  911    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  99.87 
 
 		 756 aa  1489    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  98.68 
 
 		 979 aa  1335    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  54.62 
 
 		 909 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  55.1 
 
 		 901 aa  698    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  56.08 
 
 		 888 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  99.87 
 
 		 975 aa  1484    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  98.16 
 
 		 975 aa  1323    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  71.43 
 
 		 893 aa  960    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  55.39 
 
 		 887 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  52.9 
 
 		 902 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  68.44 
 
 		 906 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  69.29 
 
 		 918 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  56.49 
 
 		 885 aa  685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.8 
 
 		 884 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.22 
 
 		 888 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  63.14 
 
 		 898 aa  816    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  71.97 
 
 		 916 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  49.86 
 
 		 865 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  52.78 
 
 		 889 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  55.56 
 
 		 886 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.94 
 
 		 884 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.49 
 
 		 888 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  52.76 
 
 		 902 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  55.94 
 
 		 884 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  53.99 
 
 		 900 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  57.77 
 
 		 928 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  52.07 
 
 		 905 aa  628  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.55 
 
 		 899 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  52.84 
 
 		 915 aa  624  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  51.42 
 
 		 897 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  51.42 
 
 		 897 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  49 
 
 		 867 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  51.26 
 
 		 889 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  51.27 
 
 		 889 aa  619  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  51.41 
 
 		 887 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  51.42 
 
 		 889 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  51.27 
 
 		 889 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  51.27 
 
 		 889 aa  619  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  50.48 
 
 		 889 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  49.72 
 
 		 882 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.93 
 
 		 891 aa  612  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  50.14 
 
 		 889 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  51.9 
 
 		 842 aa  611  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  51 
 
 		 889 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  50.57 
 
 		 889 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  50.71 
 
 		 681 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  50.85 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  50.71 
 
 		 889 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  51.77 
 
 		 849 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  49.29 
 
 		 898 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  45.38 
 
 		 895 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  82.64 
 
 		 906 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  51.75 
 
 		 846 aa  595  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  82.35 
 
 		 897 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  46.04 
 
 		 875 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  46.45 
 
 		 877 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  45.62 
 
 		 885 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  46.18 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  51.53 
 
 		 849 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  44.32 
 
 		 894 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  83.8 
 
 		 893 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.26 
 
 		 1018 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  44.7 
 
 		 687 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2129  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.05 
 
 		 1006 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0738  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.73 
 
 		 1027 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0540  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.14 
 
 		 1042 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0610  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.73 
 
 		 1030 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167508  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6053  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.04 
 
 		 903 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1679  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.73 
 
 		 1015 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.590697  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0721  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.73 
 
 		 1027 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859683  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  79.11 
 
 		 918 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  44.78 
 
 		 897 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  45.54 
 
 		 884 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  78.79 
 
 		 887 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  80.76 
 
 		 895 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  43.15 
 
 		 867 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  80.29 
 
 		 895 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.66 
 
 		 911 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44.15 
 
 		 868 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  44.52 
 
 		 911 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.75 
 
 		 923 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  44.61 
 
 		 923 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  48.51 
 
 		 878 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  43.73 
 
 		 869 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  44.19 
 
 		 919 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  39.75 
 
 		 863 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  39.35 
 
 		 863 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  39.76 
 
 		 880 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  39.72 
 
 		 865 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1361  ATPase AAA-2 domain protein  38.34 
 
 		 838 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  39.04 
 
 		 865 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  42.62 
 
 		 861 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  39.73 
 
 		 859 aa  486  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  42.16 
 
 		 866 aa  489  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  42.16 
 
 		 866 aa  489  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0389  ATP-dependent Clp protease, subunit B  41 
 
 		 867 aa  484  1e-135  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>