More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0540 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.5 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.61 
 
 		 919 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1679  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.38 
 
 		 1015 aa  1713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.590697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  46.52 
 
 		 882 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  43.75 
 
 		 916 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.2 
 
 		 897 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0738  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.38 
 
 		 1027 aa  1713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.26 
 
 		 899 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  46.28 
 
 		 889 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.34 
 
 		 898 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  46.91 
 
 		 889 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.83 
 
 		 900 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  43.57 
 
 		 911 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  47.61 
 
 		 889 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0540  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 		 1042 aa  2032    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.47 
 
 		 923 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  45.69 
 
 		 889 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.26 
 
 		 888 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  46.84 
 
 		 875 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  48.31 
 
 		 687 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2129  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.25 
 
 		 1006 aa  1721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  92.32 
 
 		 958 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  46.22 
 
 		 889 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44 
 
 		 911 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  44.67 
 
 		 889 aa  713    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  43.37 
 
 		 923 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  46.42 
 
 		 894 aa  830    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.84 
 
 		 889 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.55 
 
 		 903 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0721  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.38 
 
 		 1027 aa  1713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.71 
 
 		 889 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  47.61 
 
 		 889 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.58 
 
 		 1018 aa  1728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  47.22 
 
 		 877 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  46.1 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.5 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  45.99 
 
 		 915 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.7 
 
 		 895 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.5 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0610  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.38 
 
 		 1030 aa  1713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.2 
 
 		 897 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  44.95 
 
 		 888 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  44.68 
 
 		 849 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  50.07 
 
 		 681 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.95 
 
 		 888 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  43.81 
 
 		 979 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45 
 
 		 884 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45 
 
 		 884 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  44.09 
 
 		 975 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  43.99 
 
 		 975 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  37.5 
 
 		 867 aa  593  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.43 
 
 		 858 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.43 
 
 		 858 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  38.89 
 
 		 867 aa  585  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  36.68 
 
 		 867 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  36.43 
 
 		 863 aa  582  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  37.44 
 
 		 867 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  40.16 
 
 		 893 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1361  ATPase AAA-2 domain protein  35.68 
 
 		 838 aa  569  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  38.92 
 
 		 859 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  38.89 
 
 		 860 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  35.47 
 
 		 863 aa  568  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  37.75 
 
 		 871 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  38.32 
 
 		 880 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  37.79 
 
 		 857 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  38.79 
 
 		 864 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  37.91 
 
 		 879 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  37.63 
 
 		 861 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  41.54 
 
 		 824 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  40.56 
 
 		 874 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  38.62 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  38.21 
 
 		 863 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  37.73 
 
 		 857 aa  561  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  37.45 
 
 		 857 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  37.14 
 
 		 859 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1381  ATP-dependent chaperone ClpB  36.46 
 
 		 857 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000310398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  39.82 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  38.71 
 
 		 848 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  36.8 
 
 		 869 aa  556  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  37.76 
 
 		 874 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2046  ATP-dependent chaperone ClpB  38.09 
 
 		 871 aa  558  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  37.41 
 
 		 857 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  35.96 
 
 		 863 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  38.55 
 
 		 867 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  42.55 
 
 		 878 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.3 
 
 		 865 aa  558  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  37.76 
 
 		 931 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0121  ATPase  40.82 
 
 		 863 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  37.15 
 
 		 869 aa  556  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  37.05 
 
 		 857 aa  555  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  37.83 
 
 		 864 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  39.84 
 
 		 873 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  38.28 
 
 		 848 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2948  ATPase  37.51 
 
 		 857 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0510097 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0645  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  36.08 
 
 		 857 aa  550  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  34.93 
 
 		 865 aa  551  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1088  ATPase  37.58 
 
 		 857 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  37.76 
 
 		 857 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>