More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1221 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.11 
 
 		 880 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.89 
 
 		 882 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  44.38 
 
 		 889 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  46.94 
 
 		 875 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.92 
 
 		 910 aa  669    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  83.06 
 
 		 923 aa  1492    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.19 
 
 		 900 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  64.46 
 
 		 865 aa  1115    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  45.12 
 
 		 905 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  43.47 
 
 		 872 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  44.07 
 
 		 889 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  45.08 
 
 		 867 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  48.25 
 
 		 882 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  69.51 
 
 		 867 aa  1181    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  44.51 
 
 		 897 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  83.97 
 
 		 919 aa  1493    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  44.73 
 
 		 881 aa  666    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  43.95 
 
 		 867 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.77 
 
 		 899 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  44.7 
 
 		 889 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  43.74 
 
 		 913 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.12 
 
 		 889 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  44.24 
 
 		 880 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  57.8 
 
 		 869 aa  1005    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  44.7 
 
 		 889 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  98.57 
 
 		 911 aa  1821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  44.81 
 
 		 889 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  51.42 
 
 		 687 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  47.86 
 
 		 885 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  43.3 
 
 		 899 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  44.05 
 
 		 889 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  44.81 
 
 		 889 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  39.89 
 
 		 909 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.8 
 
 		 891 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  47.43 
 
 		 878 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  48.18 
 
 		 894 aa  787    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  83.5 
 
 		 923 aa  1497    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  64.59 
 
 		 872 aa  1138    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  44.51 
 
 		 897 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  44.81 
 
 		 889 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  44.36 
 
 		 887 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  69.39 
 
 		 867 aa  1178    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  44.48 
 
 		 865 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  47.06 
 
 		 866 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  64.8 
 
 		 865 aa  1134    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.9 
 
 		 882 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  43.17 
 
 		 889 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  57.35 
 
 		 863 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  42.29 
 
 		 893 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  43.25 
 
 		 916 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  100 
 
 		 911 aa  1841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  44.63 
 
 		 865 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  43.17 
 
 		 882 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  44.33 
 
 		 884 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  44.01 
 
 		 880 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  42.79 
 
 		 868 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  44.24 
 
 		 889 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  55.57 
 
 		 873 aa  996    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  41.76 
 
 		 902 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  47.19 
 
 		 877 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  44.18 
 
 		 889 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  41.87 
 
 		 902 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.99 
 
 		 1018 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  44.13 
 
 		 889 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  46.89 
 
 		 875 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  58.86 
 
 		 895 aa  1014    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.33 
 
 		 898 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  44.11 
 
 		 878 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.49 
 
 		 903 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.21 
 
 		 884 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.68 
 
 		 869 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  40.25 
 
 		 872 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.98 
 
 		 898 aa  632  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  43.39 
 
 		 888 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.64 
 
 		 904 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  45.33 
 
 		 889 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  44.11 
 
 		 865 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  42.95 
 
 		 887 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.39 
 
 		 888 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.39 
 
 		 888 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  42.56 
 
 		 902 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  43.09 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  42.92 
 
 		 855 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  39.96 
 
 		 897 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  43.9 
 
 		 846 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  42.54 
 
 		 887 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  42.49 
 
 		 886 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  42.29 
 
 		 909 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.75 
 
 		 906 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.58 
 
 		 885 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.58 
 
 		 885 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  41.78 
 
 		 925 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  42.35 
 
 		 891 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  43.02 
 
 		 897 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  44.51 
 
 		 849 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  43.71 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>