More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0395 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  47.83 
 
 		 866 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  47.91 
 
 		 875 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  69.69 
 
 		 911 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  45.41 
 
 		 878 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  51.81 
 
 		 687 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  67.94 
 
 		 923 aa  1156    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  43.51 
 
 		 905 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  58.94 
 
 		 863 aa  1001    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  45.87 
 
 		 867 aa  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  47.39 
 
 		 882 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  45.59 
 
 		 897 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  99.88 
 
 		 867 aa  1753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  41.05 
 
 		 902 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  44.52 
 
 		 867 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.64 
 
 		 899 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  43.6 
 
 		 913 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  41.06 
 
 		 872 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  45.91 
 
 		 889 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  45.79 
 
 		 889 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  45.02 
 
 		 865 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  44.77 
 
 		 889 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  48.04 
 
 		 885 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  45.83 
 
 		 899 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  45.05 
 
 		 889 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  68.43 
 
 		 865 aa  1151    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  43.97 
 
 		 881 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.97 
 
 		 910 aa  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  49.07 
 
 		 878 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  44.41 
 
 		 889 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  45.98 
 
 		 865 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.19 
 
 		 958 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  45.91 
 
 		 889 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  56.41 
 
 		 873 aa  993    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  46.01 
 
 		 887 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  48.27 
 
 		 894 aa  786    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.82 
 
 		 891 aa  668    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  61.95 
 
 		 869 aa  1046    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  44.87 
 
 		 889 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  44.2 
 
 		 889 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  42.94 
 
 		 893 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  43.51 
 
 		 882 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  67.51 
 
 		 865 aa  1159    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  45.91 
 
 		 889 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  67.65 
 
 		 923 aa  1155    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  68.24 
 
 		 919 aa  1156    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  42.55 
 
 		 868 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  42.99 
 
 		 884 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  45.21 
 
 		 889 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  48.16 
 
 		 877 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  47.3 
 
 		 875 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  45.3 
 
 		 865 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  44.87 
 
 		 889 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  68.65 
 
 		 872 aa  1175    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  45.79 
 
 		 889 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.21 
 
 		 902 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  69.39 
 
 		 911 aa  1174    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  45.59 
 
 		 897 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  100 
 
 		 867 aa  1756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  60.34 
 
 		 895 aa  1061    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  40.93 
 
 		 902 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  42.63 
 
 		 898 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  43.96 
 
 		 887 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  44.35 
 
 		 872 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.08 
 
 		 882 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  43.94 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  44.06 
 
 		 880 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.08 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  43.71 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  44.01 
 
 		 855 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  38.86 
 
 		 909 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  42 
 
 		 909 aa  619  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.29 
 
 		 898 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  40.46 
 
 		 916 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.2 
 
 		 904 aa  611  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  40.84 
 
 		 900 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  44 
 
 		 846 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  43.11 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  43.89 
 
 		 842 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.01 
 
 		 869 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  44.43 
 
 		 849 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  44.19 
 
 		 849 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.43 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.13 
 
 		 887 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  42.43 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  42.48 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  42.51 
 
 		 889 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  40.05 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  39.37 
 
 		 903 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  42.71 
 
 		 884 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  41.67 
 
 		 928 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  40.56 
 
 		 906 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  41.49 
 
 		 918 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  40.98 
 
 		 925 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  40.84 
 
 		 918 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  41.56 
 
 		 886 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.62 
 
 		 906 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.08 
 
 		 884 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  41.89 
 
 		 888 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  40.23 
 
 		 887 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.08 
 
 		 884 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>