More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1177 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.16 
 
 		 904 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  46.27 
 
 		 865 aa  742    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  41.98 
 
 		 875 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  44.48 
 
 		 889 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  44.11 
 
 		 909 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  46.28 
 
 		 878 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.94 
 
 		 891 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  42.45 
 
 		 887 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  42.87 
 
 		 886 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  43.51 
 
 		 905 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.21 
 
 		 887 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  41.31 
 
 		 891 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  41.08 
 
 		 885 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.96 
 
 		 898 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  41.26 
 
 		 882 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  44.99 
 
 		 897 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.61 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  46.23 
 
 		 867 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.11 
 
 		 899 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  45.29 
 
 		 889 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.72 
 
 		 888 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.27 
 
 		 898 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  43.13 
 
 		 889 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  41.62 
 
 		 913 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  45.29 
 
 		 889 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  42.76 
 
 		 901 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  45.01 
 
 		 889 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  45.29 
 
 		 889 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  41.72 
 
 		 888 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  41.26 
 
 		 887 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  45.03 
 
 		 889 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  100 
 
 		 872 aa  1797    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  41.26 
 
 		 873 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  41.08 
 
 		 885 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  42.74 
 
 		 880 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.14 
 
 		 869 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  42.84 
 
 		 899 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  44.84 
 
 		 889 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  42.27 
 
 		 893 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  41.95 
 
 		 887 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  48.28 
 
 		 882 aa  787    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  45.29 
 
 		 889 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  42.35 
 
 		 884 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  42.5 
 
 		 878 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.94 
 
 		 865 aa  648    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.42 
 
 		 903 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  42.74 
 
 		 880 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  42.53 
 
 		 918 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  41.71 
 
 		 885 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.84 
 
 		 910 aa  716    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  45.88 
 
 		 887 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  46.49 
 
 		 865 aa  756    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  42.51 
 
 		 882 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  42.13 
 
 		 916 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  40.98 
 
 		 879 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  42.53 
 
 		 863 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  46.03 
 
 		 897 aa  761    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.61 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  41.96 
 
 		 916 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  40.98 
 
 		 879 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  41.74 
 
 		 894 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.84 
 
 		 865 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  43.95 
 
 		 889 aa  719    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.61 
 
 		 888 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  41.46 
 
 		 893 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  46.28 
 
 		 865 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.76 
 
 		 908 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  39.69 
 
 		 872 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  51.22 
 
 		 681 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.61 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  42.53 
 
 		 866 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.68 
 
 		 900 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  43.83 
 
 		 902 aa  732    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  41.58 
 
 		 928 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.98 
 
 		 879 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  46.09 
 
 		 868 aa  745    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  44.99 
 
 		 897 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  45.12 
 
 		 889 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  42.91 
 
 		 897 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  43.6 
 
 		 902 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  45.04 
 
 		 855 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  42.57 
 
 		 877 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  45.15 
 
 		 889 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  42.22 
 
 		 869 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  42.29 
 
 		 882 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  42 
 
 		 875 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  45.29 
 
 		 889 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  42.14 
 
 		 889 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  42.51 
 
 		 880 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  41.08 
 
 		 885 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  42.31 
 
 		 895 aa  698    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  41.61 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.88 
 
 		 909 aa  721    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  41.26 
 
 		 895 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  42 
 
 		 884 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  43.78 
 
 		 849 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  41.3 
 
 		 918 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.87 
 
 		 906 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  40.69 
 
 		 906 aa  632  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  41.97 
 
 		 915 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>