More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0618 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  44.26 
 
 		 900 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  49.37 
 
 		 865 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  44.46 
 
 		 869 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  50.45 
 
 		 875 aa  732    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  62.05 
 
 		 882 aa  1040    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  49.01 
 
 		 878 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  43.48 
 
 		 885 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  44.17 
 
 		 906 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.46 
 
 		 888 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  47.87 
 
 		 866 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  46.04 
 
 		 905 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.23 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  45.6 
 
 		 879 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  45.41 
 
 		 879 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  61.38 
 
 		 881 aa  1011    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  45.81 
 
 		 867 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  48.42 
 
 		 882 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  46.89 
 
 		 897 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.23 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.33 
 
 		 872 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  44.65 
 
 		 902 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.99 
 
 		 908 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  48.42 
 
 		 867 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.01 
 
 		 865 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.66 
 
 		 899 aa  695    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  47.03 
 
 		 894 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.01 
 
 		 898 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  62.36 
 
 		 882 aa  1044    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  81.29 
 
 		 913 aa  1427    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.23 
 
 		 884 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  44.41 
 
 		 895 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.23 
 
 		 865 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  47.32 
 
 		 889 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  46.46 
 
 		 888 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  59.1 
 
 		 884 aa  969    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  48.63 
 
 		 865 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  46.85 
 
 		 882 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  47.2 
 
 		 885 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.23 
 
 		 903 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  49.94 
 
 		 899 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  46.55 
 
 		 889 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  45.31 
 
 		 887 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.1 
 
 		 898 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  47.21 
 
 		 889 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  50.96 
 
 		 878 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  45.69 
 
 		 885 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.81 
 
 		 958 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574997  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  52.02 
 
 		 687 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  47.43 
 
 		 887 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.21 
 
 		 889 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  48.97 
 
 		 875 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  43.48 
 
 		 891 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  44.33 
 
 		 897 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  62.06 
 
 		 880 aa  1043    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.34 
 
 		 888 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  61.53 
 
 		 884 aa  1056    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  62.06 
 
 		 880 aa  1042    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  45.26 
 
 		 916 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  44.12 
 
 		 887 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.21 
 
 		 889 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  44.03 
 
 		 909 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  47.2 
 
 		 889 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.63 
 
 		 869 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  100 
 
 		 893 aa  1792    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46 
 
 		 904 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.52 
 
 		 910 aa  693    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.61 
 
 		 891 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.52 
 
 		 887 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  46.89 
 
 		 897 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  43.58 
 
 		 863 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.71 
 
 		 909 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  62.28 
 
 		 880 aa  1044    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  43.48 
 
 		 885 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  48.57 
 
 		 865 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  44.5 
 
 		 916 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44 
 
 		 868 aa  699    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.33 
 
 		 889 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.21 
 
 		 889 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  45.07 
 
 		 902 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  49.09 
 
 		 877 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  45.76 
 
 		 889 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  46.79 
 
 		 889 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.23 
 
 		 884 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.41 
 
 		 879 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  46.61 
 
 		 889 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  46.86 
 
 		 842 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  59.58 
 
 		 902 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  43.43 
 
 		 872 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  46.9 
 
 		 889 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  45.96 
 
 		 846 aa  635  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  44.32 
 
 		 918 aa  635  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  42.41 
 
 		 873 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  43.47 
 
 		 897 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  43.5 
 
 		 855 aa  631  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  43.91 
 
 		 918 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  44.78 
 
 		 893 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  43.9 
 
 		 893 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.76 
 
 		 906 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  43.5 
 
 		 887 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  44.19 
 
 		 895 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>