More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1482 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3069  ATPase  49.13 
 
 
882 aa  800    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.87 
 
 
849 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  52.6 
 
 
879 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  46.07 
 
 
875 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  56.37 
 
 
889 aa  939    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  51.56 
 
 
889 aa  807    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.71 
 
 
879 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  51.56 
 
 
889 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  51.8 
 
 
891 aa  879    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  50.38 
 
 
905 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50.55 
 
 
891 aa  784    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  43.95 
 
 
862 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  43.85 
 
 
882 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  42.59 
 
 
863 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  50.99 
 
 
897 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.44 
 
 
884 aa  996    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  51.56 
 
 
889 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  52.01 
 
 
885 aa  885    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  50.44 
 
 
865 aa  832    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  49.73 
 
 
867 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  49.51 
 
 
899 aa  786    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  40.15 
 
 
873 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  50.99 
 
 
897 aa  802    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  43.01 
 
 
923 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  48.39 
 
 
898 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  47.29 
 
 
909 aa  770    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  44.64 
 
 
913 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.94 
 
 
872 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  53.18 
 
 
904 aa  895    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  60.65 
 
 
900 aa  1083    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  58.66 
 
 
887 aa  1041    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  51.56 
 
 
889 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  58.66 
 
 
888 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  54.86 
 
 
906 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  55.32 
 
 
975 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  60.45 
 
 
916 aa  1048    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  46.91 
 
 
846 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.44 
 
 
884 aa  996    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  43.04 
 
 
885 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  52.77 
 
 
889 aa  851    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  44.68 
 
 
899 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  50.94 
 
 
889 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  75.79 
 
 
928 aa  1330    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  54.86 
 
 
893 aa  912    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  59.31 
 
 
887 aa  1018    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.66 
 
 
888 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  45.52 
 
 
875 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  59.8 
 
 
886 aa  1006    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  56.29 
 
 
898 aa  968    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.23 
 
 
884 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.55 
 
 
888 aa  1004    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  42 
 
 
884 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  55.58 
 
 
918 aa  925    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  59.2 
 
 
885 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.99 
 
 
903 aa  875    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  51.28 
 
 
889 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  50.33 
 
 
887 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.6 
 
 
887 aa  868    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  50.95 
 
 
889 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  47.65 
 
 
842 aa  680    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  54.32 
 
 
906 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  45.15 
 
 
866 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  45.34 
 
 
897 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  59.5 
 
 
901 aa  983    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  55.24 
 
 
893 aa  910    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  54.7 
 
 
916 aa  912    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  52.71 
 
 
879 aa  871    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  59.35 
 
 
908 aa  990    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.33 
 
 
884 aa  996    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  49.13 
 
 
889 aa  797    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  52.66 
 
 
889 aa  871    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  43.1 
 
 
893 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  41.79 
 
 
880 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  41.5 
 
 
882 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  52.01 
 
 
885 aa  885    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  41.46 
 
 
882 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  45.37 
 
 
902 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  56.38 
 
 
681 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  42.1 
 
 
880 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  56.02 
 
 
887 aa  929    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  55.32 
 
 
975 aa  910    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  45.53 
 
 
868 aa  783    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  50.11 
 
 
865 aa  822    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  51.51 
 
 
889 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  55.86 
 
 
897 aa  922    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  60.97 
 
 
902 aa  1096    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  48.61 
 
 
849 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  45.43 
 
 
877 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.1 
 
 
910 aa  777    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  51.4 
 
 
889 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  43.51 
 
 
867 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  60.97 
 
 
909 aa  1120    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  41.77 
 
 
880 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  54.35 
 
 
915 aa  841    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  50.43 
 
 
889 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  60.04 
 
 
902 aa  1090    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.76 
 
 
895 aa  702    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  51.56 
 
 
889 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  43.54 
 
 
894 aa  698    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  100 
 
 
925 aa  1849    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>