More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0979 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  43.23 
 
 
880 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  49.54 
 
 
865 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  43.04 
 
 
880 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  59.42 
 
 
885 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  75.71 
 
 
887 aa  1269    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  49.77 
 
 
878 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  88.91 
 
 
893 aa  1509    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  42.27 
 
 
872 aa  661    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  66.86 
 
 
898 aa  1117    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  48.16 
 
 
905 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  74.54 
 
 
895 aa  1259    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  75.71 
 
 
906 aa  1327    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  55.25 
 
 
900 aa  906    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  61.18 
 
 
879 aa  1029    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.65 
 
 
909 aa  921    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  46.9 
 
 
909 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  47.89 
 
 
882 aa  712    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  50.06 
 
 
897 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.29 
 
 
884 aa  870    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  42.87 
 
 
880 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  45.85 
 
 
862 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  45.85 
 
 
867 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  47.82 
 
 
867 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  47.37 
 
 
899 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.32 
 
 
888 aa  874    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  76.36 
 
 
975 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  45.91 
 
 
855 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.82 
 
 
898 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.52 
 
 
902 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  44.56 
 
 
913 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  49.88 
 
 
865 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.06 
 
 
884 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.11 
 
 
904 aa  784    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  76.36 
 
 
979 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  50.52 
 
 
889 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  56.29 
 
 
888 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  74.1 
 
 
918 aa  1273    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  76.16 
 
 
975 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  60.94 
 
 
887 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  47.11 
 
 
846 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  53.64 
 
 
902 aa  906    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  54.77 
 
 
908 aa  848    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  48.45 
 
 
889 aa  739    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  44.71 
 
 
899 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  49.21 
 
 
889 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.17 
 
 
884 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  100 
 
 
893 aa  1783    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  56.05 
 
 
887 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  53.87 
 
 
916 aa  890    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.12 
 
 
910 aa  731    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.7 
 
 
891 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  49.31 
 
 
865 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  53.66 
 
 
925 aa  890    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  50.52 
 
 
889 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  74.69 
 
 
918 aa  1279    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  55.76 
 
 
885 aa  858    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.87 
 
 
903 aa  816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  50.52 
 
 
889 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  49.71 
 
 
887 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  56.75 
 
 
928 aa  918    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  53.98 
 
 
901 aa  839    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  44.05 
 
 
884 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  49.3 
 
 
889 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  42.74 
 
 
897 aa  684    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  75.59 
 
 
906 aa  1278    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  75 
 
 
895 aa  1262    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  76.93 
 
 
916 aa  1313    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  75.37 
 
 
889 aa  1261    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  48.59 
 
 
889 aa  750    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  43.9 
 
 
893 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  50.06 
 
 
897 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  50.23 
 
 
889 aa  740    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  55.93 
 
 
869 aa  894    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  61.18 
 
 
879 aa  1030    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  60.94 
 
 
879 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  55.38 
 
 
681 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  59.18 
 
 
891 aa  983    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  48.67 
 
 
889 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  50.52 
 
 
889 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.4 
 
 
888 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  55.96 
 
 
886 aa  866    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44.9 
 
 
868 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.58 
 
 
849 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  56.29 
 
 
884 aa  870    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  49.88 
 
 
889 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  42.97 
 
 
884 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  81.92 
 
 
897 aa  1407    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  53.98 
 
 
902 aa  910    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  47.41 
 
 
849 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  48.44 
 
 
842 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  50.52 
 
 
889 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  40.98 
 
 
873 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  50.35 
 
 
889 aa  736    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  59.42 
 
 
885 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  42.27 
 
 
882 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  42.13 
 
 
895 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  51.02 
 
 
915 aa  757    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  55.5 
 
 
887 aa  875    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  50.23 
 
 
889 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  42.4 
 
 
882 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>