More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0244 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  67.47 
 
 		 906 aa  1168    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  52.69 
 
 		 901 aa  834    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  48 
 
 		 905 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  50.37 
 
 		 915 aa  757    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.08 
 
 		 897 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.39 
 
 		 884 aa  851    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  47.47 
 
 		 842 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  46.51 
 
 		 867 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  98.77 
 
 		 975 aa  1748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.7 
 
 		 899 aa  725    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  44.75 
 
 		 889 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.18 
 
 		 884 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.08 
 
 		 898 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  52.63 
 
 		 916 aa  889    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  100 
 
 		 979 aa  1934    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  47.5 
 
 		 889 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  54.39 
 
 		 888 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  75.3 
 
 		 918 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  98.77 
 
 		 975 aa  1748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  75.44 
 
 		 906 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  47.73 
 
 		 846 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  46.05 
 
 		 889 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  75.83 
 
 		 893 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  54.64 
 
 		 887 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.49 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  98.55 
 
 		 756 aa  1333    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931825  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  47.48 
 
 		 889 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  75.93 
 
 		 918 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  54.58 
 
 		 885 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  52.32 
 
 		 900 aa  872    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  47.08 
 
 		 887 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.08 
 
 		 897 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  41.31 
 
 		 895 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.49 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.49 
 
 		 889 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  78.21 
 
 		 893 aa  732    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.59 
 
 		 891 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  75.3 
 
 		 895 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  72.19 
 
 		 916 aa  1298    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  78.52 
 
 		 887 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  44.48 
 
 		 889 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.5 
 
 		 888 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.71 
 
 		 1018 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.94 
 
 		 849 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  69.41 
 
 		 889 aa  1224    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.29 
 
 		 884 aa  850    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  56.88 
 
 		 928 aa  915    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0920  chaperone ClpB  98.68 
 
 		 756 aa  1335    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.53 
 
 		 909 aa  942    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  49.52 
 
 		 889 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  79.61 
 
 		 897 aa  757    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  44.97 
 
 		 889 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  75.3 
 
 		 895 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.39 
 
 		 884 aa  851    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  40.04 
 
 		 894 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  43.81 
 
 		 875 aa  632  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2129  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.43 
 
 		 1006 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  43.93 
 
 		 877 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0738  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.3 
 
 		 1027 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1679  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.3 
 
 		 1015 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.590697  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0540  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.99 
 
 		 1042 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0610  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.3 
 
 		 1030 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167508  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0721  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.3 
 
 		 1027 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  60.82 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  60.82 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  60.43 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  60.43 
 
 		 887 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  40.76 
 
 		 885 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  40.74 
 
 		 882 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6053  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 903 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  38.28 
 
 		 897 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  40.08 
 
 		 923 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  58.69 
 
 		 885 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  45.01 
 
 		 687 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  58.69 
 
 		 885 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.81 
 
 		 911 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  40.46 
 
 		 911 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.5 
 
 		 923 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  38.88 
 
 		 867 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  39.98 
 
 		 919 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  58.11 
 
 		 891 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  47.99 
 
 		 681 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  35.32 
 
 		 863 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  55.82 
 
 		 869 aa  538  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  35.42 
 
 		 863 aa  535  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  40.75 
 
 		 880 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  42.78 
 
 		 861 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  53.29 
 
 		 887 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  35.37 
 
 		 865 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2046  ATP-dependent chaperone ClpB  36.04 
 
 		 871 aa  531  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  37.91 
 
 		 862 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_002620  TC0389  ATP-dependent Clp protease, subunit B  38.9 
 
 		 867 aa  523  1e-147  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1271  ATP-dependent chaperone ClpB  37.79 
 
 		 862 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  39.89 
 
 		 865 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  40.36 
 
 		 859 aa  521  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  37.82 
 
 		 866 aa  522  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  37.82 
 
 		 866 aa  522  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  34.42 
 
 		 863 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  41.13 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  41.53 
 
 		 864 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>