More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6053 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  44.35 
 
 		 902 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  45.05 
 
 		 878 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  44.81 
 
 		 905 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6053  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  100 
 
 		 903 aa  1795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  43.66 
 
 		 882 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  44.53 
 
 		 897 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.78 
 
 		 891 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  45.16 
 
 		 889 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  44.96 
 
 		 867 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  44.3 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.55 
 
 		 899 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  44.94 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  47.68 
 
 		 842 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  44.94 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  46.7 
 
 		 882 aa  707    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  44.96 
 
 		 889 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  45.56 
 
 		 865 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  45.08 
 
 		 855 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  44.74 
 
 		 889 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  44.9 
 
 		 887 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3023  ATPase AAA-2  54.84 
 
 		 864 aa  785    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.825053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  44.73 
 
 		 897 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  41.73 
 
 		 872 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  44.94 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  44.53 
 
 		 897 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  44.95 
 
 		 889 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  45.01 
 
 		 906 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  44.94 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44.06 
 
 		 868 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  45.09 
 
 		 889 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  44.12 
 
 		 902 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  45.16 
 
 		 889 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  42.62 
 
 		 884 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  44.94 
 
 		 889 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  45.56 
 
 		 865 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.91 
 
 		 909 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  43.11 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  43.78 
 
 		 913 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  43.11 
 
 		 885 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  42.76 
 
 		 885 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  43.8 
 
 		 893 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  44.22 
 
 		 916 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  44.67 
 
 		 887 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.21 
 
 		 895 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.49 
 
 		 910 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.55 
 
 		 906 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  44.13 
 
 		 880 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.47 
 
 		 898 aa  632  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  44.9 
 
 		 918 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  44.56 
 
 		 889 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  43.28 
 
 		 900 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.18 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  43.91 
 
 		 916 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  47.4 
 
 		 846 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.77 
 
 		 869 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  44.02 
 
 		 880 aa  628  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  43.15 
 
 		 893 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  42.79 
 
 		 891 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  43.98 
 
 		 881 aa  625  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  43.56 
 
 		 918 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  44.1 
 
 		 879 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  43.56 
 
 		 895 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  43.56 
 
 		 895 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  44.27 
 
 		 897 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  43.98 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  44.94 
 
 		 887 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  41.69 
 
 		 894 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.88 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.75 
 
 		 887 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.63 
 
 		 898 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  43.42 
 
 		 877 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  43.87 
 
 		 893 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.23 
 
 		 849 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.19 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  47.5 
 
 		 849 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  43.03 
 
 		 875 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  44.86 
 
 		 887 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.02 
 
 		 884 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.03 
 
 		 882 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.82 
 
 		 908 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  42.15 
 
 		 909 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  42.97 
 
 		 866 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  45.33 
 
 		 875 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  44.15 
 
 		 901 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  41.09 
 
 		 867 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  44.35 
 
 		 888 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  46.22 
 
 		 878 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.41 
 
 		 903 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  43.23 
 
 		 902 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  44.29 
 
 		 889 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  45.45 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  41.94 
 
 		 899 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  50.51 
 
 		 681 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  44.65 
 
 		 886 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.06 
 
 		 888 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.38 
 
 		 904 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.12 
 
 		 884 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.12 
 
 		 884 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  44.65 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.12 
 
 		 888 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>