More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2129 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.92 
 
 		 889 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0721  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.66 
 
 		 1027 aa  1712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.01 
 
 		 909 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  46.47 
 
 		 905 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.76 
 
 		 911 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  47.46 
 
 		 882 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.61 
 
 		 897 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0738  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.66 
 
 		 1027 aa  1712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  48.03 
 
 		 889 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.9 
 
 		 900 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.5 
 
 		 899 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.48 
 
 		 898 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1679  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.66 
 
 		 1015 aa  1712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.590697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.19 
 
 		 903 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  48.03 
 
 		 889 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0540  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.24 
 
 		 1042 aa  1714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.61 
 
 		 897 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  46.52 
 
 		 889 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  43.7 
 
 		 869 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.94 
 
 		 923 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  44.07 
 
 		 919 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0610  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.66 
 
 		 1030 aa  1712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  91.13 
 
 		 958 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  43.54 
 
 		 911 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.54 
 
 		 1018 aa  1726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  41.26 
 
 		 891 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.16 
 
 		 865 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.99 
 
 		 889 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.92 
 
 		 889 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  48.45 
 
 		 687 aa  684    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  47.1 
 
 		 875 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.92 
 
 		 889 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.08 
 
 		 885 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.34 
 
 		 888 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.08 
 
 		 885 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2129  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 		 1006 aa  1963    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  47.47 
 
 		 877 aa  767    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  46.67 
 
 		 894 aa  834    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  43.72 
 
 		 923 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  46.24 
 
 		 915 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  43.89 
 
 		 916 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  44.06 
 
 		 895 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  45.03 
 
 		 979 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.35 
 
 		 888 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.34 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.34 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.34 
 
 		 884 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  45.09 
 
 		 849 aa  622  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.34 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  45.32 
 
 		 975 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  45.2 
 
 		 888 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  45.03 
 
 		 975 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  37.3 
 
 		 867 aa  592  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  38.51 
 
 		 867 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  36.33 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  38.45 
 
 		 880 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.4 
 
 		 858 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.4 
 
 		 858 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6053  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 903 aa  585  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  38.91 
 
 		 867 aa  582  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  36.69 
 
 		 867 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  35.47 
 
 		 863 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  36.83 
 
 		 859 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  37.46 
 
 		 867 aa  572  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1361  ATPase AAA-2 domain protein  35.9 
 
 		 838 aa  569  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  35.87 
 
 		 864 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  39.13 
 
 		 864 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  38.94 
 
 		 859 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  34.66 
 
 		 865 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  38.84 
 
 		 860 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  37.5 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  36.78 
 
 		 864 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  39.73 
 
 		 864 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  37.55 
 
 		 854 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3639  ATPase  37.51 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  37.43 
 
 		 871 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5181  ATP-dependent chaperone ClpB  39.17 
 
 		 854 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  40.3 
 
 		 893 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  39.17 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  36.94 
 
 		 859 aa  568  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  38.04 
 
 		 862 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  40.7 
 
 		 874 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  37.61 
 
 		 883 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  36.66 
 
 		 869 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  38.76 
 
 		 848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000860565  decreased coverage  0.000000635783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  38.76 
 
 		 848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1195  chaperone  37.82 
 
 		 879 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  38.76 
 
 		 848 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  37.68 
 
 		 857 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000839096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  37.57 
 
 		 857 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  38.53 
 
 		 848 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>