More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0738 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.15 
 
 
897 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0738  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 
1027 aa  2004    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  44.27 
 
 
916 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.36 
 
 
899 aa  727    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.41 
 
 
865 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2129  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.66 
 
 
1006 aa  1729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.45 
 
 
889 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  47.56 
 
 
889 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0540  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.38 
 
 
1042 aa  1719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  45.15 
 
 
888 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.36 
 
 
888 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  46.74 
 
 
885 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  46.52 
 
 
894 aa  831    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.87 
 
 
900 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0721  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.51 
 
 
1027 aa  1991    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.71 
 
 
919 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2031  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  98.92 
 
 
1018 aa  1961    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1679  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.9 
 
 
1015 aa  1976    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.590697  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  91.13 
 
 
958 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574997  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  48.18 
 
 
687 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  46.84 
 
 
875 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  45.64 
 
 
889 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44 
 
 
911 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.45 
 
 
889 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.45 
 
 
889 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.84 
 
 
889 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  44.67 
 
 
889 aa  713    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  43.78 
 
 
911 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.58 
 
 
923 aa  666    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.02 
 
 
889 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  47.22 
 
 
877 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  45.22 
 
 
889 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  43.57 
 
 
923 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  46 
 
 
889 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  47.56 
 
 
889 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  45.99 
 
 
915 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.81 
 
 
895 aa  734    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0610  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.71 
 
 
1030 aa  1996    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.15 
 
 
897 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.09 
 
 
888 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.14 
 
 
884 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  44.58 
 
 
849 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.14 
 
 
884 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.14 
 
 
884 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.14 
 
 
884 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  43.91 
 
 
979 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  49.66 
 
 
681 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  44.17 
 
 
975 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  44.14 
 
 
975 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  35.9 
 
 
863 aa  588  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  38.99 
 
 
867 aa  585  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.43 
 
 
858 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  38.43 
 
 
858 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  37.39 
 
 
867 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6053  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  41.5 
 
 
903 aa  585  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  36.57 
 
 
867 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  37.44 
 
 
867 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  38.81 
 
 
859 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  38.61 
 
 
860 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  39.93 
 
 
893 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1361  ATPase AAA-2 domain protein  35.68 
 
 
838 aa  569  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  37.75 
 
 
871 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  39.11 
 
 
864 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  35.98 
 
 
864 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  35.36 
 
 
863 aa  568  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  41.72 
 
 
824 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  36.85 
 
 
859 aa  565  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  34.86 
 
 
865 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  36.93 
 
 
859 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  40.56 
 
 
874 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  37.62 
 
 
857 aa  561  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  37.69 
 
 
857 aa  562  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1381  ATP-dependent chaperone ClpB  36.46 
 
 
857 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000310398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.95 
 
 
865 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  38.21 
 
 
863 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  37.34 
 
 
857 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  38.84 
 
 
892 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  39.82 
 
 
861 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  38.71 
 
 
848 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  37.3 
 
 
857 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  37.76 
 
 
874 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  35.86 
 
 
863 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  36.7 
 
 
869 aa  555  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  37.76 
 
 
931 aa  555  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2948  ATPase  37.12 
 
 
857 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0510097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  37.15 
 
 
869 aa  556  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  36.94 
 
 
857 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0121  ATPase  40.82 
 
 
863 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  38.13 
 
 
867 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  37.47 
 
 
857 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000997344  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0993  ATPase  41.09 
 
 
869 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0974  ATPase  41.09 
 
 
869 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1019  ATPase  37.47 
 
 
857 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00163715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10389  endopeptidase ATP binding protein subunit B clpB  38.95 
 
 
848 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000533203  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1088  ATPase  37.47 
 
 
857 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  37.5 
 
 
864 aa  552  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1207  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  46.69 
 
 
756 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  40 
 
 
889 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  37.65 
 
 
857 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  37.28 
 
 
857 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>