More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2425 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2425  oligopeptide ABC transporter permease protein  100 
 
 
333 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2151  oligopeptide transport system, permease  94.59 
 
 
333 aa  591  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2494  oligopeptide transport system, permease  94.31 
 
 
334 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.49 
 
 
333 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00388552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2230  hypothetical protein  83.58 
 
 
335 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2359  oligopeptide transport system permease protein OppC  83.18 
 
 
333 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2166  oligopeptide ABC transporter, permease  93.97 
 
 
204 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2411  oligopeptide ABC transporter permease protein  93.97 
 
 
201 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
334 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4481  ABC transporter, permease protein  46.08 
 
 
334 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0851521 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0698  oligopeptide ABC transporter, permease  47.29 
 
 
334 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0897  ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7867999999999997e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0893  peptide ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00188095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0764  oligopeptide transport system permease  46.39 
 
 
334 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.176645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5742  ABC transporter permease  46.39 
 
 
334 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0274362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0965  ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
334 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0707697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0712  oligopeptide transport system, permease  46.39 
 
 
334 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000119617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0855  ABC transporter, permease protein  46.91 
 
 
334 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3074  hypothetical protein  30.45 
 
 
339 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2112  hypothetical protein  31.07 
 
 
349 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2268  hypothetical protein  31.07 
 
 
339 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
339 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2051  oligopeptide transport system, permease  30.77 
 
 
349 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000479974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2049  oligopeptide transport system, permease  31.07 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2251  hypothetical protein  30.15 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2294  hypothetical protein  30.77 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2297  hypothetical protein  31.23 
 
 
339 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2379  hypothetical protein  30.47 
 
 
339 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.079532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
346 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127169  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0027  oligopeptide transport system permease  23.34 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00373339  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  27.01 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.95 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.07 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.41 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34310  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  27.2 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  24.81 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640342  normal  0.816795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.05 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.73 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  25.56 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.11 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275681  normal  0.0822975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  22.35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  22.35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
603 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  23.48 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.77 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1287  peptide ABC transporter, permease protein  23.46 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03990  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  25.59 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.518636  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  24.44 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.35 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.766345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  24.61 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5182  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  26.32 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  22 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.27 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.74 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  24.1 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.53 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.05 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.57 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4834  putative ABC transporter (permease protein)  26.11 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  24.59 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5136  putative peptide ABC transporter permease protein, oppC-like protein  26.07 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.41 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  25.7 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01868  hypothetical protein  24.23 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  24.03 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  23.48 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  24.06 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.58 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000206381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2960  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.62 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>