More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2200 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
333 aa  675    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00388552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2359  oligopeptide transport system permease protein OppC  85.29 
 
 
333 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2151  oligopeptide transport system, permease  85.59 
 
 
333 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2425  oligopeptide ABC transporter permease protein  86.49 
 
 
333 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2494  oligopeptide transport system, permease  86.53 
 
 
334 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2230  hypothetical protein  82.39 
 
 
335 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2411  oligopeptide ABC transporter permease protein  82.91 
 
 
201 aa  318  9e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2166  oligopeptide ABC transporter, permease  82.91 
 
 
204 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
334 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4481  ABC transporter, permease protein  46.11 
 
 
334 aa  291  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0851521 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0698  oligopeptide ABC transporter, permease  47.29 
 
 
334 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0897  ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
334 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7867999999999997e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0893  peptide ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 
334 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00188095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0764  oligopeptide transport system permease  46.39 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.176645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5742  ABC transporter permease  46.39 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0274362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0965  ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0707697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0712  oligopeptide transport system, permease  46.08 
 
 
334 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000119617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0855  ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
334 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
339 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2112  hypothetical protein  28.96 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2251  hypothetical protein  29.55 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2051  oligopeptide transport system, permease  28.66 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000479974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2294  hypothetical protein  28.96 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2268  hypothetical protein  28.96 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3074  hypothetical protein  29.55 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2049  oligopeptide transport system, permease  28.96 
 
 
349 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2297  hypothetical protein  30.09 
 
 
339 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2379  hypothetical protein  29.25 
 
 
339 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.079532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
346 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127169  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0027  oligopeptide transport system permease  25 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00373339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.45 
 
 
310 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  25.1 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.43 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  23.57 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4834  putative ABC transporter (permease protein)  30 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.3 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.69 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  26.29 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  23.29 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.71 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5182  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  27.39 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34310  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  27.62 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.766345 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640342  normal  0.816795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  21.37 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.77 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  20.97 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  20.97 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  20.97 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  22.18 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.97 
 
 
298 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  20.97 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  20.97 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.1 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  23.87 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.46 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  23.46 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.77 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275681  normal  0.0822975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.11 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.45 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  25.94 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  24 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  23.32 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.75 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  20.56 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.75 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.955086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  24.1 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1287  peptide ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.46 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01868  hypothetical protein  25.87 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.18 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.46 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.46 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  24.6 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  23.46 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.69 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  23.46 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  23.46 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>