198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0271 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  65.26 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  62.11 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  61.05 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  54.74 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  62.11 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  59.55 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  61.33 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  55.43 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  61.05 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  58.43 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  58.43 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  53.66 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  54.64 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  50.53 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  62.9 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  61.9 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  65.33 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  53.41 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  44.94 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  45.16 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  50.6 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  58.73 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  58.73 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  50.62 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  51.47 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  60.38 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  47.44 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.05 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  37.78 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  35.11 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  34.04 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  42.86 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  34.04 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  35.35 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  44.94 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  46.97 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.73 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  39.02 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  42.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  41.57 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  39.02 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  39.02 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  41.25 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.84 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  35.37 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.84 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  35.37 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  35.37 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  35.37 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.84 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 182 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  37.97 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  34.74 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  37.23 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  36.49 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  38.82 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  38.27 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.71 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>