222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5096 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  99.49 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  97.96 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  98.47 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  66.15 
 
 		 196 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  65.62 
 
 		 196 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  60.62 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  64.74 
 
 		 196 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  61.14 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  60.62 
 
 		 197 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  45.4 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  38.92 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.13 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  37.77 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  43.43 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  40.13 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  40.34 
 
 		 182 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  41.48 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  37.7 
 
 		 180 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  40.46 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  38.64 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  41.29 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  38.32 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  39.2 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  40.61 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  39.26 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  40.96 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  39.25 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  41.32 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  37.91 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  38.2 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  39.88 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  37.06 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  36.7 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  39.88 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  39.26 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  36.97 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  33.87 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  39.52 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  36.97 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  36.97 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  36.97 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  36.97 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.13 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  35.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  37.79 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  35.43 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  39.49 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  37.42 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  35.23 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  35.54 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  35.67 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.74 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.57 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  35.68 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  36.73 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.82 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  36.53 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.82 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  36.53 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  36.53 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  36.53 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.82 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35.26 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2416  hypothetical protein  33.15 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  31.49 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  37.21 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  33.13 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  35.06 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  35.88 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  32.57 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3700  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  34.5 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  34.38 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  29.45 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40 
 
 		 104 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>