214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0110 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  233  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  88.54 
 
 		 96 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  89.58 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  88.54 
 
 		 96 aa  156  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  94.79 
 
 		 96 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  94.79 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  69.79 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  62.11 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  61.18 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  49.07 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  61.36 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  60.27 
 
 		 194 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  57.14 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  55.79 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  61.33 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  60.27 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  57.53 
 
 		 96 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.07 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  60.81 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  45.74 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  61.76 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  65.33 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  55.71 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  54.17 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  59.38 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  47.73 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  52.81 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  43.21 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.54 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  38.89 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  39 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  38.61 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  44.74 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  41.86 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  41.86 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  41.86 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  41.86 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  41.86 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  41.86 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  41.86 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  54.55 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  41.86 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  41.86 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  41.86 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  40.7 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  35.96 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.56 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  42.19 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  35.9 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  41.79 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  41.79 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  41.79 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  41.79 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  42.25 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>