125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0341 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
124 aa  246  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  68.75 
 
 
101 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  70.21 
 
 
96 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  69.15 
 
 
95 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  73.4 
 
 
95 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  66.2 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  37.62 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  45.33 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  38.95 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  39.42 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  43.84 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  41.98 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  38.3 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  44.29 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  38.71 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  42.25 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  43.42 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  41.1 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
96 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  38.04 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  38.04 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  31.91 
 
 
189 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  30.85 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.14 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  43.66 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  29.73 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  48.84 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.94 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
187 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
96 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.56 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  31.76 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  37.23 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  44 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 
183 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  38.36 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  47.73 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.53 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  32.82 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  32 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  32.82 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  32.82 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0338  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171919  hitchhiker  0.00000000521514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  38.2 
 
 
184 aa  42  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  32 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  32.82 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  35 
 
 
94 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 
184 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  32.82 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  32.82 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  32.82 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
197 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  28.89 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  34.34 
 
 
184 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  28.28 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  28.28 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  28.28 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  28.28 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>