191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3372 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
96 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  70.83 
 
 
114 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  77.08 
 
 
194 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  77.08 
 
 
96 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  69.79 
 
 
96 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  71.58 
 
 
96 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  70.21 
 
 
103 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  55.21 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  56.32 
 
 
99 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  58.06 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  58.06 
 
 
96 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  54.26 
 
 
97 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  60.22 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  59.14 
 
 
96 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  56.98 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  56.98 
 
 
96 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  51.22 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  58.67 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  66.18 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  61.76 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  61.76 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  48.15 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  47.67 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  55.71 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  62.67 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  48.68 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  49.4 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  51.14 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  54.43 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  46.15 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  54.84 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  44.94 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  36.96 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 
194 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  40.96 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  40.96 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  40.96 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  40.96 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  40.96 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  40.96 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  44.93 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  40.24 
 
 
188 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  39.76 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  40.24 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  40.24 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  32.14 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  39.76 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  37.93 
 
 
100 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  39.53 
 
 
92 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 
92 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.87 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
189 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  38.27 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  32.22 
 
 
178 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
187 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  40 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  37.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  37.04 
 
 
196 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.04 
 
 
196 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 
85 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  34.83 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  32.26 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  30.23 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>