195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0989 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
114 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  88.6 
 
 
194 aa  184  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  92.71 
 
 
96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  76.6 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  73.96 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  72.45 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  70.83 
 
 
96 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  64.71 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  57.95 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  60.64 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  50.51 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  60 
 
 
96 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  63.51 
 
 
96 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 
103 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  57.47 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  53.66 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  57.65 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  56.47 
 
 
96 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  60 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  61.43 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  48.35 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  64 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  57.35 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  51.19 
 
 
102 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  52.17 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  59.68 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  60.66 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  41.98 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  48.68 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  42.35 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  55.38 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  46.15 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  43.18 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.53 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  39.58 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  38.04 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  52.73 
 
 
99 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
194 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  37.78 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  37.78 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  38.36 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  32.65 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.5 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  41.25 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
186 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
186 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 
196 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 
107 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  34.74 
 
 
188 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 
196 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  37.93 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  38.67 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  33.01 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 
196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.31 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 
184 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  35 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  40.58 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  40.58 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  36 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  40.91 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 
87 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  40.51 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  37.08 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>