213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0057 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  82.29 
 
 		 96 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  81.25 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  72.92 
 
 		 96 aa  150  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  88.54 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  87.5 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  87.5 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  65.26 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  63.64 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  63.38 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  63.01 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  65.33 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  55.91 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  60.27 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  63.01 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  51.06 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  61.76 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  46.07 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  68 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  53.12 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  54.32 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  51.35 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  53.42 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  58.33 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  52.81 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  39.29 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  45.56 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.3 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  43.62 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  38.89 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  44.74 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  52.73 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.37 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.37 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.37 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.37 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.37 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.37 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.37 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.08 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  52.27 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.08 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  39.53 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  37.65 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  37.65 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.37 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  38.46 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.18 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  36.47 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 192 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>