216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1165 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 105 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  71.43 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  65.38 
 
 		 104 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  64.29 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  52 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  49.49 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  47.37 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  47.87 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  60 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  48.81 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  57.58 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  57.58 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  47.87 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  46.67 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  44.44 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  44.55 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  45.98 
 
 		 199 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  44.68 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  52.56 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  48.19 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  48.19 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  48.96 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  43.75 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  47.19 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  36.73 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  36.73 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  47.83 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  43.18 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  43.59 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  43.53 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  47.95 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  42.35 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  55 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  41.05 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 		 194 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  41.3 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  47.67 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  47.67 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  38.78 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  41.77 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  53.33 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  37.23 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  38.2 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 197 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  43.94 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.06 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 196 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  38.38 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  42.53 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  47.76 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  39.44 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  38.03 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.1 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  39.44 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  42.55 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  29.58 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  32.14 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  39.44 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.57 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.36 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.57 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.36 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.36 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.36 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.57 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  40.23 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  38.03 
 
 		 196 aa  57  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.06 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 184 aa  57  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.23 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  31.58 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  37.29 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  40.79 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  42.35 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  39.39 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  42.35 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>