189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3096 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 102 aa  200  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  52.48 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  51.9 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  47.25 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  44.94 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  50.65 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  46.07 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  43.82 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  43.82 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  51.32 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  46.05 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  48.86 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  45.83 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  46.91 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  41.98 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  45.68 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  47.19 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  45.71 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  46.07 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  45.71 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  46.07 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  52.31 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  45.76 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  49.15 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  48.28 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  45.33 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  45.61 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  45.61 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  45.61 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  56.86 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  41.57 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  35.29 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  49.15 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  34.48 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  34.12 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  31.25 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.71 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  34.83 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  34.83 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  32.93 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 184 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  36.11 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  36.62 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  31.17 
 
 		 196 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  38.04 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  39.44 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  32.99 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  42.19 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  35.23 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  32.94 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.09 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  31.76 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  41.54 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  37.14 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  33.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  36 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  33.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  33.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  37.7 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  37.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  37.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  37.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>