207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0508 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  72.92 
 
 		 96 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  72.92 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  71.88 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  70.83 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  69.79 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  68.75 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  64.71 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  64.71 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  54.74 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  65.88 
 
 		 194 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  62.35 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  61.29 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  62.35 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  58.06 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  63.01 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  59.76 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  56.99 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  62.67 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  64.29 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  69.33 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  56.25 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  63.24 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  43.82 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  44.09 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  48.81 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  63.54 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  54.79 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  44.87 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  48.65 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  43.53 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.43 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  48.05 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  42.5 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  32.18 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  54.55 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  38.82 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  31.46 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  43.59 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.56 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  36.9 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  40.66 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.66 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  40.66 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.56 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  35.48 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  40.45 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  39.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  41.18 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  42.31 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  42.31 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  42.31 
 
 		 213 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  42.31 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  42.31 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  42.31 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  34.83 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  39.33 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.12 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.12 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  38.96 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  44.05 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  38.96 
 
 		 184 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  41.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 188 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  35.87 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  40.28 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  37.66 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>