207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1492 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 109 aa  213  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 109 aa  213  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  74.73 
 
 		 94 aa  139  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  66.67 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  55.56 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  54.17 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  53.49 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  41 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  34.69 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  40.82 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  43.94 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  40.23 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  36.25 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  33.75 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  41.03 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  36.67 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  37.21 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  37.89 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  44.93 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  32.29 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.21 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  40.86 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.75 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.5 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 196 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  32.95 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.43 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.62 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  36.9 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  39.76 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  37.5 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  42.55 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  40.79 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.75 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.75 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.75 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.75 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1260  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  39.02 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  37.5 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.59 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  40.43 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  30.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  30.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  30.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  30.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  30.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>