197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4152 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  73.96 
 
 		 114 aa  146  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  77.89 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  76.04 
 
 		 194 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  76.04 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  76.6 
 
 		 103 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  56.32 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  69.79 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  56.99 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  54.26 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  52.08 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  56.99 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  66.67 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  58.62 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  55.91 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  55.91 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  56.98 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  56.98 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  66.67 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  57.35 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  55.88 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  53.09 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  54.41 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  54.29 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  53.95 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  50.68 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  54.84 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  42.86 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  50.63 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  40.45 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  58.49 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.66 
 
 		 105 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  35.87 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.04 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  41.3 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  42.17 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  42.17 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  39.13 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.08 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  41.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  41.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  41.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  37.63 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  50.91 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  35.71 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  41.25 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  37.63 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  38.04 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.96 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  34.15 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  37.08 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  45.71 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  36.56 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  38.75 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  32.61 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  32.56 
 
 		 184 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  32.98 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  38.38 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  32.22 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  38.37 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>