206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0415 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
107 aa  207  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  65.59 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  63.44 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  65.59 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  55.21 
 
 
104 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  56.84 
 
 
105 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  47.37 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  43.16 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  38.61 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  42.27 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  42.27 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  46.84 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  46.58 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  41.77 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  39.33 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  44.87 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  40.82 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  42 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  44.58 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  34.04 
 
 
196 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.04 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 
196 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  34.57 
 
 
197 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 
196 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  36.08 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  49.18 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  32.26 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  35.35 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.61 
 
 
189 aa  58.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.1 
 
 
197 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40.91 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  36.46 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.43 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  30.86 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  48.94 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  31.94 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  30.56 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  30.56 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  47.83 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  35.44 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  47.83 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  47.83 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  36.78 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  34.52 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.96 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 
114 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  33 
 
 
188 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  40.58 
 
 
95 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.96 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.96 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  36.9 
 
 
192 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.96 
 
 
213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.96 
 
 
213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.96 
 
 
213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.96 
 
 
213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  41.54 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  34.09 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  35.71 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  39.24 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  38.16 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  35 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>