144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0679 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 98 aa  185  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  62.89 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  53.61 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  49.49 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  51.06 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  47.42 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  64.62 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  42.71 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  49.41 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  44.68 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  43.68 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  37.76 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  63.16 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  62.07 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  40.22 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  38.04 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  54.55 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  40.82 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  44.87 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  35.79 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  41.38 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  29.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  31.17 
 
 		 180 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  36.36 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 192 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.09 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  32.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  28.41 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  32.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  32.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  32.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  32.5 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  32.5 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  32.5 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.43 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  34.85 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  28.72 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  34.57 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.08 
 
 		 196 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  32.84 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  37.1 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  35.14 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  38.67 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.35 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  32.93 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  31.76 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  34.18 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  35.82 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  31.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.72 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>