89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1901 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 100 aa  197  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  63 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  62.89 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  63.92 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  57.58 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  60.24 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  55.21 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  49.41 
 
 		 98 aa  85.9  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  47.87 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  41 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  40 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  45.78 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  43.3 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  44.12 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  35.35 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  40.82 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  38.2 
 
 		 196 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  38.67 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  33.68 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  42.19 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.46 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  34.67 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  34.67 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  41.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  41.07 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  41.07 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  40.35 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  29.87 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  29.41 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  29.27 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  38.67 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  36.17 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  34.38 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  34.38 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  32.98 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  28.95 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.72 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 184 aa  43.5  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  32.56 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  26.6 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  31.46 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 184 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  31.25 
 
 		 184 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  31.4 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  38.46 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  34.85 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  32.18 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  35.38 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  35.29 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>