235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1411 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 84 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  60.98 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  57.83 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  49.38 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  45.95 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  46.75 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  47.3 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  39.29 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  44.16 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  49.23 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  43.37 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  43.37 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  43.37 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  43.37 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  43.37 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  43.37 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  44.16 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  48.57 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  44.16 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  44.16 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  36.59 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  50 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  45.71 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  39.74 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  37.8 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  44.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  40.24 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  46.15 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  48.33 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  41.54 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  41.54 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  31.25 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  31.25 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  31.25 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  31.25 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  37.33 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  39.06 
 
 		 199 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.06 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40.32 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  39.47 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  33.73 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  29.76 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.9 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  35.44 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.68 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  30 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  34.38 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  38.55 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  42.19 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  42.19 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  36.23 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  38.89 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  39.02 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.81 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.67 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  58.54 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  58.54 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  34.67 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3520  protein of unknown function YGGT  35.23 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>