107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1547 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  100 
 
 		 97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  62.89 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  53.61 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  60.44 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  46.39 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  49.44 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  41.24 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  47.25 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  44.79 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  42.27 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  52.87 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  43.01 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  42.22 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  37.11 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  44.79 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  47.78 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  47.78 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  53.16 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 		 199 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  42 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 192 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  40.58 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  37.18 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  29.27 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  38.2 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  28.72 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  27.66 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  27.66 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  28.72 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.8 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  37.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  34.52 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  36.36 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  36.36 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  30.59 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  27.59 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  36.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  36.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  30.59 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  35 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  30.43 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  26.44 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  29.76 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  40.98 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  30.12 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  36.71 
 
 		 184 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 184 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  39.34 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  34.85 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  28.72 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  40.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>