102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1379 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  100 
 
 		 97 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  55.67 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  48.42 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  47.42 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  46.39 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.71 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  41.67 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  56.25 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  40.21 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  37.11 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  39.36 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  45.56 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  44.44 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  44.59 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  39.36 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  49.21 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  33.68 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  43.86 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  30.11 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  31.4 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  30.11 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  39.06 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.38 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.38 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  34.83 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  38.57 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  37.97 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.94 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  29.07 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  34.33 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  25.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  32.26 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 196 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  34.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  34.92 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  30.26 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  31.87 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  30.49 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  34.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  34.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  34.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  34.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  28.38 
 
 		 99 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  41.51 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  31.88 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  28.17 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  28.17 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  28.17 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  30.26 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  31.15 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  31.15 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  31.15 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  31.15 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  38.6 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 84 aa  40  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  25.64 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>