53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0261 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 99 aa  191  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  48.86 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  39.39 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  44.79 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  38.38 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.4 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  48.86 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  45.65 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  47.83 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  40.82 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  41.67 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  37.5 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  44.12 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  43.02 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  44.83 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.08 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  45.88 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  45.88 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  33.7 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  48 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  29.07 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  37.21 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 192 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  33.8 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  36.59 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  29.17 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  33.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  29.58 
 
 		 194 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1998  hypothetical protein  40.32 
 
 		 191 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1993  hypothetical protein  40.32 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  26.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  26.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  37.7 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.94 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  25.61 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  26.14 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  32.97 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>