186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0615 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  49.45 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  54.29 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  54.67 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  47.44 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  46.99 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  47.37 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  45.95 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  42.39 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  42.7 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  37.23 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  41.86 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  46.67 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  46.77 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  36.59 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  36.9 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 192 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  48.15 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  43.94 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  43.94 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  43.94 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  39.58 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40.32 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  38.36 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  38.75 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  42.39 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  42.39 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  45.31 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  45.31 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  42.39 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  40.85 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  40.85 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  45.31 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  45.31 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  45.31 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  35.16 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 196 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  30.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  29.41 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  34.48 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  42.03 
 
 		 192 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  38.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.62 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  37.33 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  36.62 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  38.82 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  30.12 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  30.12 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  31.43 
 
 		 193 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  33.78 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  34.57 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  32.14 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  43.75 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  43.75 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>