96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09240 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  100 
 
 
96 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  38.82 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1484  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  41.1 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 
87 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 
192 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.71 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  37.04 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  44.59 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  37.36 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 
196 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.93 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  39.19 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  31.17 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  31.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  30.34 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  39.19 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  28.57 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  33.33 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  38.71 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  31.52 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  35.42 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  33.33 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  37.31 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  31.82 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  37.31 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
197 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  30.88 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  31.65 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  27.27 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1317  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00152206  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35.82 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  31.58 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  26.8 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  35.82 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  38.98 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  33.73 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  26.8 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  32.43 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  35.14 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  35.14 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  32.88 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  32.88 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  35.14 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  35.14 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  32.88 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  29.03 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  34.85 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  29.07 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  28.41 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  32.88 
 
 
187 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 
188 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2416  hypothetical protein  33.78 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  32.94 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>