32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1484 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1484  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 114 aa  220  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  34.88 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  32 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.71 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.65 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  38.1 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  46.88 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  41.1 
 
 		 96 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  38.96 
 
 		 194 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  38.96 
 
 		 197 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.66 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  33.85 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  31.65 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  30.85 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1577  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  34.83 
 
 		 87 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>