216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3527 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  188  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  64.71 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  57.95 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  61.84 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  64.38 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  62.86 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  58.44 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  55.43 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  58.9 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  57.65 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  57.65 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  59.34 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  63.77 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  56.47 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  60.24 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  60.24 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  58.82 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  61.54 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  61.11 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  61.54 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  47.25 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  67.8 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  52.5 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  49.37 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  54.79 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  72.55 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  53.42 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  56.45 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  56.92 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  37.78 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  41.84 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  51.47 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  41.98 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  34.88 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  41.76 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  40.43 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  35.05 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  44.59 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  35.05 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.97 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.97 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  43.75 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  40.74 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  34.02 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  38.37 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.83 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  38.82 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  34.02 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  44.29 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  35.96 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  42.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  42.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  42.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>