88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2017 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  71.26 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  70.45 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  68.54 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  68.54 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  64.37 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  68.54 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  65.88 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  58.82 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  57.95 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  52.87 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  50.59 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  56.25 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  49.41 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  58.54 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  60.27 
 
 		 109 aa  95.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  47.92 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  48.28 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  46.25 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  54.72 
 
 		 57 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  41.54 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  34.62 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  34.62 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  38.81 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  35.9 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  38.96 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  31.91 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  44.29 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  35.9 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  37.33 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  43.4 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  51.11 
 
 		 101 aa  43.5  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  39.66 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  37.93 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  41.82 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  34.29 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  32.26 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  32.29 
 
 		 196 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  37.1 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  42.47 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  42.86 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  40.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  34.62 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  55.56 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  44.23 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1484  protein of unknown function YGGT  35.11 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  45.83 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.46 
 
 		 196 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  39.39 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  45.83 
 
 		 192 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 105 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  44.23 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  31.46 
 
 		 196 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  46.67 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>