104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3708 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
94 aa  184  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  69.15 
 
 
95 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  68.82 
 
 
97 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  67.74 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  71.26 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  61.29 
 
 
94 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  68.09 
 
 
96 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  68.09 
 
 
96 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  55.95 
 
 
119 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  53.57 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  42.55 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  60 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  53.57 
 
 
110 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  52.38 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  41.49 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  42.55 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  54.29 
 
 
109 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  40.43 
 
 
102 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  42.67 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  51.92 
 
 
57 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  37.8 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  46.77 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  34.25 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  42.65 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  42.62 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  36.67 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  37.08 
 
 
87 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  36.62 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  36.62 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
199 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  32.47 
 
 
98 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  37.97 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  28.92 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  31.75 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  30.99 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  38.33 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  42.86 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  26.97 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  39.06 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  30.49 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  30.59 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  44.64 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  43.75 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.51 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  43.33 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  43.33 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  32.14 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  26.92 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  36.23 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  37.31 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  35.71 
 
 
104 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
84 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  31.88 
 
 
107 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  36.36 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  32.89 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 
180 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  36.23 
 
 
76 aa  41.2  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  35.09 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
78 aa  41.2  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  32 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  29.73 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  38.89 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  31.51 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  31.65 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  43.75 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  32.05 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  27.71 
 
 
192 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>